В том, что начали болеть икроножные мышцы, после возобнавления тренировочных занятий, ничего страшного нет. Главное держать этот процесс под контролем. Скорее всего у вас немного изменилась техника бега, стали более активно проводить отталкивание стопой от дорожки или поднялись на стопе во время бега "стараетесь пяткой не касаться дорожки".В связи с этим обратите на данные движения особое внимание, если при увеличении усилия при отталкивании, боль через некоторое время усиливается, значит сбавляйте скорость, и ставьте пятку на опору. После пробежек обязательно проведите востановительные процедуры, погреть ноги в теплой воде, а перед сном легкий массаж с разогревающим кремом. Можно и ничего не делать, постепенно само рассосется, если не будете себя перегружать.