во время бега по всему организму идут процессы выработки энергии и переработки продуктов распада. ногами бежим, а остальные мышцы, допустим, помогают расщеплять продукты распада. например, чем больше в мышце митохондрий (отвечают, так скажем, за "дыхание" клетки) - тем больше эта мышца выработает энергии или съест ненужных веществ, тем легче ногам бежать и тд. таких примеров еще много. суть в том, что адаптируем эффективно все тело, чтобы все мышцы помогали или не мешали бегу, не только с т.зрения силы работы, но и с т.зрения вспомогательных процессов, влияющих на все тело.
конешн, если тренируем ненужные мышцы, то они наоборот будут мешать, отнимать кислород, создавать вес и тд во время забега. но это понятно.
ну и элементарное. бежим ногами, а ни у кого не уставали никогда мышцы спины, живота, шеи? надо тренировать.
ну про растяжку и так ясно. волокна/ мышцы сжимаются-разжимаются. бывают просто нелепые движения, резкие или от усталости, когда техника разваливается и нагрузка резко может придтись на отдельные волокна, ну им и не хватит прочности (представим, что мы гнем пять макаронин или двадцать штук - пять легко сломаются, если укрепить, то уже посопротивляются сильнее).
плюс при закислении или неразогретые мышцы менее эластичные, от привычных нагрузок могут потянуться. растяжка предотвращает повреждение.
как-то так.